La fondation du club sous le nom de Elche Football Club (fusion entre le Sporting de Elche et le Gimnastica de Elche) date de 1922. La date officielle de création est lee 28 août 1923. Le club est renommé Elche Club de Fútbol en 1939. Le plus bel exploit du club est d’accéder à la finale de la Coupe d’Espagne en 1969. Elche s’incline 0-1 contre les basques de l’Athletic Bilbao.
En 1959, Elche fait ses débuts en première division sur la pelouse du Real Oviedo et obtient un match nul 1-1 grâce à un but de Pahuet, le premier meilleur buteur du club. Lors de la deuxième journée, Elche se paie le luxe de gagner 2-1 contre le grand FC Barcelone de Luis Suárez, Ramallets et Evaristo, grâce à des buts de Pahuet et Cardona. Le club achèvera la saison parmi l’élite par une encourageante 10ème place. La saison suivante, le club se maintient en Liga après un barrage contre Ceuta. Au match aller, Elche s’incline 0-1. Au retour, le club remporte le match 4-0 et s’assure une autre saison en première division. La saison 1963-1964 reste encore dans toutes les mémoires. Elche obtient le meilleur classement de son histoire avec une belle cinquième place. L’équipe de rêve est composée de Pazos, Chancho, Iborra, Quirant, Ramos, Forneris, Cardona, Lezcano, Eulogio, Romero et Oviedo. Elche s’impose dans son stade contre des adversaires de la stature du Real Madrid, de Valence, de l’Atlético de Madrid, de Saragosse ou de Séville. À mi-parcours du championnat, Elche se bat pour le titre de champion avec le F.C. Barcelone. Dans la seconde partie du championnat, l’éqiuipe enchaîne une série de mauvais résultats et est finalement reléguée à la cinquième place.
Lors de la saison 2014-2015 et en raison de ses trop nombreuses dettes, le club est rétrogradé administrativement en Segunda, malgré une 13ème place en championnat. Elche connaît une saison 2016-2017 difficile et subit la relégation en Segunda Division B, l’équivalent du National en France. Toutefois, le club se ressaisit rapidement et remonte dès la saison suivante en Segunda. Lors de la saison 2019-2020, Elche termine à la sixième place du championnat et accède aux barrages de promotion. Le club s’impose contre le Real Saragosse en demi-finale et rejoint en finale le Girona FC. Après un 0-0 au match aller, le 24 août 2020 Elche remporte le match retour de la finale 1-0 au bout du temps additionnel sur un but de Pere Milla à la 90ème +6. L’équipe s’impose sur son second tir et son seul tir cadré de la partie malgré une possession de balle de 54%. Les joueurs ont joué en supériorité numérique pendant plus de trente minutes suite à l’expulsion de Stuani, joueur de Girona. Cinq ans après l’avoir quittée, Elche retrouve la Liga. Au bout d’une saison spectaculaire conclue par 16 matchs sans défaites et 5 victoires en 6 matchs de barrage, les joueurs font descendre la ville dans les rues pour célébrer un succès historique.
